Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFRA3O60609 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms