Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF9O60383 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF9O60383 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF9O60383 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF9O60383 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF9O60383 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF9O60383 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF9O60383 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF9O60383 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF9O60383 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF9O60383 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF9O60383 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF9O60383 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF9O60383 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF9O60383 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF9O60383 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF9O60383 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF9O60383 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF9O60383 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF9O60383 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF9O60383 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF9O60383 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF9O60383 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF9O60383 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF9O60383 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF9O60383 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF9O60383 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms