Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCXO43602 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCXO43602 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCXO43602 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCXO43602 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCXO43602 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCXO43602 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCXO43602 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DCXO43602 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DCXO43602 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCXO43602 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCXO43602 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCXO43602 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCXO43602 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCXO43602 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCXO43602 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCXO43602 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCXO43602 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCXO43602 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCXO43602 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms