Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8B1O43520 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B1O43520 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms