Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS1O00470 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms