Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms