Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF879B4DU55 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms