Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms