Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00587B1AMM8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms