Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNZ2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNZ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNZ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A6NNZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNZ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNZ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNZ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNZ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNZ2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNZ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms