Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer3W4VSP1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer3W4VSP1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer3W4VSP1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer3W4VSP1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer3W4VSP1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer3W4VSP1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer3W4VSP1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer3W4VSP1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer3W4VSP1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer3W4VSP1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer3W4VSP1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer3W4VSP1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer3W4VSP1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer3W4VSP1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer3W4VSP1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer3W4VSP1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer3W4VSP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer3W4VSP1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer3W4VSP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer3W4VSP1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer3W4VSP1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Speer3W4VSP1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer3W4VSP1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer3W4VSP1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms