Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ilf3Q9Z1X4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ilf3Q9Z1X4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ilf3Q9Z1X4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ilf3Q9Z1X4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ilf3Q9Z1X4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ilf3Q9Z1X4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ilf3Q9Z1X4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ilf3Q9Z1X4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ilf3Q9Z1X4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ilf3Q9Z1X4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ilf3Q9Z1X4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ilf3Q9Z1X4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ilf3Q9Z1X4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ilf3Q9Z1X4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ilf3Q9Z1X4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ilf3Q9Z1X4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ilf3Q9Z1X4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ilf3Q9Z1X4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ilf3Q9Z1X4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ilf3Q9Z1X4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms