Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N2

Orc1, Origin recognition complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc1Q9Z1N2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Orc1Q9Z1N2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Orc1Q9Z1N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Orc1Q9Z1N2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Orc1Q9Z1N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc1Q9Z1N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Orc1Q9Z1N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Orc1Q9Z1N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Orc1Q9Z1N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Orc1Q9Z1N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Orc1Q9Z1N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Orc1Q9Z1N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Orc1Q9Z1N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Orc1Q9Z1N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Orc1Q9Z1N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Orc1Q9Z1N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Orc1Q9Z1N2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Orc1Q9Z1N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Orc1Q9Z1N2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Orc1Q9Z1N2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Orc1Q9Z1N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Orc1Q9Z1N2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Orc1Q9Z1N2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Orc1Q9Z1N2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Orc1Q9Z1N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Orc1Q9Z1N2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Orc1Q9Z1N2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Orc1Q9Z1N2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Orc1Q9Z1N2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Orc1Q9Z1N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Orc1Q9Z1N2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Orc1Q9Z1N2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Orc1Q9Z1N2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms