Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Cacna2d3Q9Z1L5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cacna2d3Q9Z1L5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cacna2d3Q9Z1L5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cacna2d3Q9Z1L5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Cacna2d3Q9Z1L5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Cacna2d3Q9Z1L5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Cacna2d3Q9Z1L5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Cacna2d3Q9Z1L5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,2■■□□□ 1,79
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,14■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Cacna2d3Q9Z1L5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Cacna2d3Q9Z1L5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Cacna2d3Q9Z1L5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Cacna2d3Q9Z1L5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,2 ms