Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sumo3Q9Z172 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sumo3Q9Z172 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sumo3Q9Z172 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sumo3Q9Z172 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sumo3Q9Z172 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sumo3Q9Z172 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sumo3Q9Z172 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sumo3Q9Z172 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sumo3Q9Z172 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sumo3Q9Z172 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sumo3Q9Z172 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sumo3Q9Z172 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sumo3Q9Z172 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sumo3Q9Z172 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sumo3Q9Z172 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sumo3Q9Z172 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sumo3Q9Z172 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sumo3Q9Z172 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sumo3Q9Z172 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sumo3Q9Z172 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sumo3Q9Z172 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sumo3Q9Z172 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sumo3Q9Z172 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sumo3Q9Z172 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sumo3Q9Z172 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms