Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tusc2Q9WVF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tusc2Q9WVF8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tusc2Q9WVF8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tusc2Q9WVF8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tusc2Q9WVF8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tusc2Q9WVF8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tusc2Q9WVF8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tusc2Q9WVF8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tusc2Q9WVF8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tusc2Q9WVF8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tusc2Q9WVF8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tusc2Q9WVF8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tusc2Q9WVF8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tusc2Q9WVF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tusc2Q9WVF8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tusc2Q9WVF8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tusc2Q9WVF8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tusc2Q9WVF8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tusc2Q9WVF8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tusc2Q9WVF8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tusc2Q9WVF8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tusc2Q9WVF8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms