Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx1Q9WV80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx1Q9WV80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx1Q9WV80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx1Q9WV80 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx1Q9WV80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx1Q9WV80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx1Q9WV80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx1Q9WV80 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx1Q9WV80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx1Q9WV80 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx1Q9WV80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx1Q9WV80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx1Q9WV80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx1Q9WV80 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx1Q9WV80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx1Q9WV80 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx1Q9WV80 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx1Q9WV80 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx1Q9WV80 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx1Q9WV80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx1Q9WV80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx1Q9WV80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx1Q9WV80 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx1Q9WV80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx1Q9WV80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx1Q9WV80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx1Q9WV80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx1Q9WV80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx1Q9WV80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx1Q9WV80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms