Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TapbpQ9R233 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TapbpQ9R233 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TapbpQ9R233 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TapbpQ9R233 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TapbpQ9R233 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TapbpQ9R233 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TapbpQ9R233 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TapbpQ9R233 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TapbpQ9R233 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TapbpQ9R233 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TapbpQ9R233 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TapbpQ9R233 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TapbpQ9R233 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TapbpQ9R233 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TapbpQ9R233 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TapbpQ9R233 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TapbpQ9R233 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TapbpQ9R233 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TapbpQ9R233 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TapbpQ9R233 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TapbpQ9R233 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms