Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trex2Q9R1A9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trex2Q9R1A9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trex2Q9R1A9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trex2Q9R1A9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trex2Q9R1A9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trex2Q9R1A9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trex2Q9R1A9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trex2Q9R1A9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trex2Q9R1A9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trex2Q9R1A9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trex2Q9R1A9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trex2Q9R1A9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trex2Q9R1A9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trex2Q9R1A9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trex2Q9R1A9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trex2Q9R1A9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trex2Q9R1A9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trex2Q9R1A9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trex2Q9R1A9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trex2Q9R1A9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trex2Q9R1A9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trex2Q9R1A9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms