Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syt9Q9R0N9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syt9Q9R0N9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syt9Q9R0N9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syt9Q9R0N9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syt9Q9R0N9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt9Q9R0N9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt9Q9R0N9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt9Q9R0N9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt9Q9R0N9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt9Q9R0N9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt9Q9R0N9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt9Q9R0N9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syt9Q9R0N9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt9Q9R0N9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt9Q9R0N9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt9Q9R0N9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt9Q9R0N9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt9Q9R0N9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt9Q9R0N9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms