Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nubp2Q9R061 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nubp2Q9R061 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nubp2Q9R061 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nubp2Q9R061 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nubp2Q9R061 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nubp2Q9R061 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nubp2Q9R061 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nubp2Q9R061 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nubp2Q9R061 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nubp2Q9R061 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nubp2Q9R061 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nubp2Q9R061 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nubp2Q9R061 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nubp2Q9R061 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nubp2Q9R061 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nubp2Q9R061 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nubp2Q9R061 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nubp2Q9R061 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nubp2Q9R061 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nubp2Q9R061 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nubp2Q9R061 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nubp2Q9R061 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nubp2Q9R061 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nubp2Q9R061 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nubp2Q9R061 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nubp2Q9R061 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms