Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM5

Rnd2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd2Q9QYM5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms