Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Msh5Q9QUM7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Msh5Q9QUM7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Msh5Q9QUM7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Msh5Q9QUM7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Msh5Q9QUM7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Msh5Q9QUM7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msh5Q9QUM7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msh5Q9QUM7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Msh5Q9QUM7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Msh5Q9QUM7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Msh5Q9QUM7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msh5Q9QUM7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Msh5Q9QUM7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Msh5Q9QUM7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Msh5Q9QUM7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Msh5Q9QUM7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Msh5Q9QUM7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Msh5Q9QUM7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msh5Q9QUM7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msh5Q9QUM7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Msh5Q9QUM7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Msh5Q9QUM7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msh5Q9QUM7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msh5Q9QUM7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Msh5Q9QUM7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Msh5Q9QUM7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Msh5Q9QUM7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Msh5Q9QUM7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Msh5Q9QUM7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msh5Q9QUM7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Msh5Q9QUM7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msh5Q9QUM7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Msh5Q9QUM7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msh5Q9QUM7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Msh5Q9QUM7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msh5Q9QUM7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msh5Q9QUM7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Msh5Q9QUM7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msh5Q9QUM7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msh5Q9QUM7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msh5Q9QUM7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msh5Q9QUM7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msh5Q9QUM7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms