Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Cul3Q9JLV5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Cul3Q9JLV5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Cul3Q9JLV5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cul3Q9JLV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cul3Q9JLV5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Cul3Q9JLV5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cul3Q9JLV5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Cul3Q9JLV5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Cul3Q9JLV5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cul3Q9JLV5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cul3Q9JLV5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Cul3Q9JLV5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cul3Q9JLV5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Cul3Q9JLV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Cul3Q9JLV5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Cul3Q9JLV5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cul3Q9JLV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Cul3Q9JLV5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cul3Q9JLV5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Cul3Q9JLV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cul3Q9JLV5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms