Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul3Q9JLV5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul3Q9JLV5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul3Q9JLV5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul3Q9JLV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul3Q9JLV5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cul3Q9JLV5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul3Q9JLV5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul3Q9JLV5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul3Q9JLV5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul3Q9JLV5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul3Q9JLV5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul3Q9JLV5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul3Q9JLV5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul3Q9JLV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul3Q9JLV5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul3Q9JLV5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul3Q9JLV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul3Q9JLV5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul3Q9JLV5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cul3Q9JLV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms