Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkd2l2Q9JLG4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Pkd2l2Q9JLG4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pkd2l2Q9JLG4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pkd2l2Q9JLG4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Pkd2l2Q9JLG4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Pkd2l2Q9JLG4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pkd2l2Q9JLG4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Pkd2l2Q9JLG4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Pkd2l2Q9JLG4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Pkd2l2Q9JLG4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Pkd2l2Q9JLG4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Pkd2l2Q9JLG4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pkd2l2Q9JLG4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pkd2l2Q9JLG4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Pkd2l2Q9JLG4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Pkd2l2Q9JLG4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Pkd2l2Q9JLG4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Pkd2l2Q9JLG4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pkd2l2Q9JLG4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Pkd2l2Q9JLG4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Pkd2l2Q9JLG4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Pkd2l2Q9JLG4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Pkd2l2Q9JLG4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Pkd2l2Q9JLG4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pkd2l2Q9JLG4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pkd2l2Q9JLG4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Pkd2l2Q9JLG4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Pkd2l2Q9JLG4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Pkd2l2Q9JLG4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pkd2l2Q9JLG4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Pkd2l2Q9JLG4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Pkd2l2Q9JLG4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms