Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nectin3Q9JLB9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nectin3Q9JLB9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nectin3Q9JLB9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nectin3Q9JLB9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nectin3Q9JLB9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nectin3Q9JLB9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nectin3Q9JLB9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nectin3Q9JLB9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nectin3Q9JLB9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nectin3Q9JLB9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nectin3Q9JLB9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nectin3Q9JLB9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nectin3Q9JLB9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nectin3Q9JLB9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nectin3Q9JLB9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nectin3Q9JLB9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nectin3Q9JLB9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms