Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ78

Pbk, Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbkQ9JJ78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PbkQ9JJ78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PbkQ9JJ78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PbkQ9JJ78 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PbkQ9JJ78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PbkQ9JJ78 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PbkQ9JJ78 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbkQ9JJ78 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PbkQ9JJ78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PbkQ9JJ78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PbkQ9JJ78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PbkQ9JJ78 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PbkQ9JJ78 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PbkQ9JJ78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbkQ9JJ78 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbkQ9JJ78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PbkQ9JJ78 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PbkQ9JJ78 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PbkQ9JJ78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PbkQ9JJ78 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PbkQ9JJ78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PbkQ9JJ78 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PbkQ9JJ78 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PbkQ9JJ78 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PbkQ9JJ78 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PbkQ9JJ78 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PbkQ9JJ78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PbkQ9JJ78 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PbkQ9JJ78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PbkQ9JJ78 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PbkQ9JJ78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PbkQ9JJ78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PbkQ9JJ78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PbkQ9JJ78 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PbkQ9JJ78 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PbkQ9JJ78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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