Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClpxQ9JHS4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClpxQ9JHS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClpxQ9JHS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms