Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc4Q9ES56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc4Q9ES56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc4Q9ES56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc4Q9ES56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc4Q9ES56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc4Q9ES56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc4Q9ES56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc4Q9ES56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc4Q9ES56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc4Q9ES56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc4Q9ES56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc4Q9ES56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc4Q9ES56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc4Q9ES56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc4Q9ES56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc4Q9ES56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc4Q9ES56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc4Q9ES56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc4Q9ES56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc4Q9ES56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc4Q9ES56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc4Q9ES56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc4Q9ES56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc4Q9ES56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc4Q9ES56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc4Q9ES56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc4Q9ES56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc4Q9ES56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc4Q9ES56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc4Q9ES56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc4Q9ES56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc4Q9ES56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc4Q9ES56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc4Q9ES56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc4Q9ES56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms