Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndel1Q9ERR1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndel1Q9ERR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndel1Q9ERR1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndel1Q9ERR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndel1Q9ERR1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndel1Q9ERR1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndel1Q9ERR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndel1Q9ERR1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndel1Q9ERR1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndel1Q9ERR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndel1Q9ERR1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndel1Q9ERR1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndel1Q9ERR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndel1Q9ERR1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndel1Q9ERR1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndel1Q9ERR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndel1Q9ERR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndel1Q9ERR1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndel1Q9ERR1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndel1Q9ERR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndel1Q9ERR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms