Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrnb2Q9ERK7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrnb2Q9ERK7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrnb2Q9ERK7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrnb2Q9ERK7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrnb2Q9ERK7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrnb2Q9ERK7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrnb2Q9ERK7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrnb2Q9ERK7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrnb2Q9ERK7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrnb2Q9ERK7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrnb2Q9ERK7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrnb2Q9ERK7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrnb2Q9ERK7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrnb2Q9ERK7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chrnb2Q9ERK7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrnb2Q9ERK7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrnb2Q9ERK7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrnb2Q9ERK7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrnb2Q9ERK7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrnb2Q9ERK7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrnb2Q9ERK7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrnb2Q9ERK7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrnb2Q9ERK7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms