Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Col4a3bpQ9EQG9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Col4a3bpQ9EQG9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Col4a3bpQ9EQG9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Col4a3bpQ9EQG9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Col4a3bpQ9EQG9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Col4a3bpQ9EQG9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Col4a3bpQ9EQG9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Col4a3bpQ9EQG9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Col4a3bpQ9EQG9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Col4a3bpQ9EQG9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Col4a3bpQ9EQG9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Col4a3bpQ9EQG9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Col4a3bpQ9EQG9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Col4a3bpQ9EQG9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Col4a3bpQ9EQG9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Col4a3bpQ9EQG9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Col4a3bpQ9EQG9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col4a3bpQ9EQG9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Col4a3bpQ9EQG9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Col4a3bpQ9EQG9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Col4a3bpQ9EQG9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Col4a3bpQ9EQG9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Col4a3bpQ9EQG9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Col4a3bpQ9EQG9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Col4a3bpQ9EQG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Col4a3bpQ9EQG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Col4a3bpQ9EQG9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Col4a3bpQ9EQG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Col4a3bpQ9EQG9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Col4a3bpQ9EQG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Col4a3bpQ9EQG9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Col4a3bpQ9EQG9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Col4a3bpQ9EQG9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Col4a3bpQ9EQG9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Col4a3bpQ9EQG9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Col4a3bpQ9EQG9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Col4a3bpQ9EQG9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Col4a3bpQ9EQG9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Col4a3bpQ9EQG9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col4a3bpQ9EQG9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col4a3bpQ9EQG9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Col4a3bpQ9EQG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Col4a3bpQ9EQG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,3 ms