Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col4a3bpQ9EQG9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col4a3bpQ9EQG9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col4a3bpQ9EQG9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col4a3bpQ9EQG9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col4a3bpQ9EQG9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col4a3bpQ9EQG9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Col4a3bpQ9EQG9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col4a3bpQ9EQG9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col4a3bpQ9EQG9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col4a3bpQ9EQG9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col4a3bpQ9EQG9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col4a3bpQ9EQG9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a3bpQ9EQG9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col4a3bpQ9EQG9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Col4a3bpQ9EQG9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col4a3bpQ9EQG9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col4a3bpQ9EQG9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col4a3bpQ9EQG9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a3bpQ9EQG9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col4a3bpQ9EQG9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col4a3bpQ9EQG9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col4a3bpQ9EQG9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Col4a3bpQ9EQG9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col4a3bpQ9EQG9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col4a3bpQ9EQG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a3bpQ9EQG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a3bpQ9EQG9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a3bpQ9EQG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a3bpQ9EQG9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a3bpQ9EQG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a3bpQ9EQG9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a3bpQ9EQG9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a3bpQ9EQG9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col4a3bpQ9EQG9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col4a3bpQ9EQG9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col4a3bpQ9EQG9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col4a3bpQ9EQG9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col4a3bpQ9EQG9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col4a3bpQ9EQG9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms