Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG3

Scel, Sciellin, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScelQ9EQG3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ScelQ9EQG3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScelQ9EQG3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScelQ9EQG3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ScelQ9EQG3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ScelQ9EQG3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScelQ9EQG3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScelQ9EQG3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScelQ9EQG3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScelQ9EQG3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScelQ9EQG3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScelQ9EQG3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScelQ9EQG3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScelQ9EQG3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ScelQ9EQG3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScelQ9EQG3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScelQ9EQG3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScelQ9EQG3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScelQ9EQG3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScelQ9EQG3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ScelQ9EQG3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ScelQ9EQG3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScelQ9EQG3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScelQ9EQG3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScelQ9EQG3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScelQ9EQG3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScelQ9EQG3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScelQ9EQG3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ScelQ9EQG3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScelQ9EQG3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScelQ9EQG3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScelQ9EQG3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScelQ9EQG3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms