Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcr6Q9EQ16 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr6Q9EQ16 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr6Q9EQ16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcr6Q9EQ16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr6Q9EQ16 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcr6Q9EQ16 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcr6Q9EQ16 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcr6Q9EQ16 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcr6Q9EQ16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr6Q9EQ16 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr6Q9EQ16 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcr6Q9EQ16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcr6Q9EQ16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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