Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms