Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20Q9DCC8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tomm20Q9DCC8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tomm20Q9DCC8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tomm20Q9DCC8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20Q9DCC8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20Q9DCC8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20Q9DCC8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tomm20Q9DCC8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tomm20Q9DCC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tomm20Q9DCC8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms