Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
CrotQ9DC50 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
CrotQ9DC50 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
CrotQ9DC50 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
CrotQ9DC50 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CrotQ9DC50 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
CrotQ9DC50 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
CrotQ9DC50 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
CrotQ9DC50 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
CrotQ9DC50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
CrotQ9DC50 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CrotQ9DC50 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
CrotQ9DC50 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
CrotQ9DC50 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
CrotQ9DC50 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
CrotQ9DC50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
CrotQ9DC50 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
CrotQ9DC50 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
CrotQ9DC50 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
CrotQ9DC50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
CrotQ9DC50 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
CrotQ9DC50 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
CrotQ9DC50 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
CrotQ9DC50 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
CrotQ9DC50 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,44■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
CrotQ9DC50 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
CrotQ9DC50 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
CrotQ9DC50 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
CrotQ9DC50 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
CrotQ9DC50 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CrotQ9DC50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,2■■□□□ 1,63
CrotQ9DC50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,9 ms