Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ5

Eif3k, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3kQ9DBZ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Eif3kQ9DBZ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Eif3kQ9DBZ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Eif3kQ9DBZ5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Eif3kQ9DBZ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Eif3kQ9DBZ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Eif3kQ9DBZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Eif3kQ9DBZ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Eif3kQ9DBZ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Eif3kQ9DBZ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Eif3kQ9DBZ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Eif3kQ9DBZ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Eif3kQ9DBZ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Eif3kQ9DBZ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Eif3kQ9DBZ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Eif3kQ9DBZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Eif3kQ9DBZ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Eif3kQ9DBZ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,31
Eif3kQ9DBZ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Eif3kQ9DBZ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Eif3kQ9DBZ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Eif3kQ9DBZ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Eif3kQ9DBZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Eif3kQ9DBZ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Eif3kQ9DBZ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Eif3kQ9DBZ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Eif3kQ9DBZ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Eif3kQ9DBZ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Eif3kQ9DBZ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22,83■■□□□ 1,25
Eif3kQ9DBZ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Eif3kQ9DBZ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Eif3kQ9DBZ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Eif3kQ9DBZ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Eif3kQ9DBZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Eif3kQ9DBZ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms