Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr53Q9DB94 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Wdr53Q9DB94 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Wdr53Q9DB94 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr53Q9DB94 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Wdr53Q9DB94 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr53Q9DB94 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr53Q9DB94 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Wdr53Q9DB94 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Wdr53Q9DB94 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Wdr53Q9DB94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Wdr53Q9DB94 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Wdr53Q9DB94 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Wdr53Q9DB94 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Wdr53Q9DB94 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Wdr53Q9DB94 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Wdr53Q9DB94 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Wdr53Q9DB94 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr53Q9DB94 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr53Q9DB94 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Wdr53Q9DB94 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr53Q9DB94 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr53Q9DB94 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wdr53Q9DB94 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms