Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc54Q9DAL3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc54Q9DAL3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc54Q9DAL3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc54Q9DAL3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc54Q9DAL3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc54Q9DAL3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc54Q9DAL3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc54Q9DAL3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc54Q9DAL3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc54Q9DAL3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc54Q9DAL3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc54Q9DAL3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc54Q9DAL3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc54Q9DAL3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc54Q9DAL3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc54Q9DAL3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc54Q9DAL3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc54Q9DAL3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc54Q9DAL3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc54Q9DAL3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc54Q9DAL3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc54Q9DAL3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc54Q9DAL3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc54Q9DAL3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc54Q9DAL3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc54Q9DAL3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc54Q9DAL3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms