Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntd1Q9D995 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntd1Q9D995 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntd1Q9D995 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntd1Q9D995 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntd1Q9D995 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntd1Q9D995 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntd1Q9D995 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntd1Q9D995 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntd1Q9D995 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntd1Q9D995 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntd1Q9D995 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntd1Q9D995 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntd1Q9D995 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntd1Q9D995 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntd1Q9D995 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntd1Q9D995 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntd1Q9D995 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntd1Q9D995 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms