Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chp2Q9D869 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chp2Q9D869 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chp2Q9D869 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chp2Q9D869 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chp2Q9D869 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chp2Q9D869 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chp2Q9D869 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chp2Q9D869 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chp2Q9D869 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chp2Q9D869 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chp2Q9D869 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chp2Q9D869 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chp2Q9D869 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chp2Q9D869 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chp2Q9D869 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chp2Q9D869 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chp2Q9D869 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chp2Q9D869 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chp2Q9D869 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chp2Q9D869 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chp2Q9D869 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chp2Q9D869 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chp2Q9D869 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chp2Q9D869 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chp2Q9D869 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chp2Q9D869 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chp2Q9D869 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chp2Q9D869 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chp2Q9D869 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chp2Q9D869 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chp2Q9D869 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms