Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6S7

Mrrf, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrrfQ9D6S7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MrrfQ9D6S7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MrrfQ9D6S7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MrrfQ9D6S7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MrrfQ9D6S7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MrrfQ9D6S7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MrrfQ9D6S7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MrrfQ9D6S7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MrrfQ9D6S7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MrrfQ9D6S7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MrrfQ9D6S7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MrrfQ9D6S7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MrrfQ9D6S7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MrrfQ9D6S7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MrrfQ9D6S7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MrrfQ9D6S7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MrrfQ9D6S7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms