Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam227bQ9D518 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam227bQ9D518 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam227bQ9D518 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam227bQ9D518 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam227bQ9D518 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam227bQ9D518 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam227bQ9D518 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam227bQ9D518 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam227bQ9D518 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam227bQ9D518 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam227bQ9D518 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam227bQ9D518 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam227bQ9D518 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam227bQ9D518 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam227bQ9D518 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam227bQ9D518 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam227bQ9D518 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam227bQ9D518 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam227bQ9D518 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam227bQ9D518 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam227bQ9D518 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam227bQ9D518 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam227bQ9D518 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam227bQ9D518 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam227bQ9D518 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam227bQ9D518 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam227bQ9D518 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam227bQ9D518 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam227bQ9D518 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam227bQ9D518 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam227bQ9D518 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms