Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx11Q9D3G5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx11Q9D3G5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx11Q9D3G5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx11Q9D3G5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx11Q9D3G5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx11Q9D3G5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx11Q9D3G5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx11Q9D3G5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx11Q9D3G5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx11Q9D3G5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx11Q9D3G5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx11Q9D3G5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx11Q9D3G5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stx11Q9D3G5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx11Q9D3G5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx11Q9D3G5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx11Q9D3G5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx11Q9D3G5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx11Q9D3G5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx11Q9D3G5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms