Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim42Q9D2H5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim42Q9D2H5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim42Q9D2H5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim42Q9D2H5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim42Q9D2H5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim42Q9D2H5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim42Q9D2H5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim42Q9D2H5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim42Q9D2H5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim42Q9D2H5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim42Q9D2H5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim42Q9D2H5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim42Q9D2H5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim42Q9D2H5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim42Q9D2H5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim42Q9D2H5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim42Q9D2H5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim42Q9D2H5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim42Q9D2H5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim42Q9D2H5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim42Q9D2H5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim42Q9D2H5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim42Q9D2H5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim42Q9D2H5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim42Q9D2H5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim42Q9D2H5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim42Q9D2H5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim42Q9D2H5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim42Q9D2H5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim42Q9D2H5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms