Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Necap2Q9D1J1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Necap2Q9D1J1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Necap2Q9D1J1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Necap2Q9D1J1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Necap2Q9D1J1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Necap2Q9D1J1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Necap2Q9D1J1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Necap2Q9D1J1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Necap2Q9D1J1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Necap2Q9D1J1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necap2Q9D1J1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Necap2Q9D1J1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Necap2Q9D1J1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Necap2Q9D1J1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Necap2Q9D1J1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Necap2Q9D1J1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Necap2Q9D1J1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Necap2Q9D1J1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necap2Q9D1J1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Necap2Q9D1J1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Necap2Q9D1J1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Necap2Q9D1J1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Necap2Q9D1J1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Necap2Q9D1J1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Necap2Q9D1J1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Necap2Q9D1J1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms