Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrto4Q9D0I8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrto4Q9D0I8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrto4Q9D0I8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrto4Q9D0I8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrto4Q9D0I8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrto4Q9D0I8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrto4Q9D0I8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrto4Q9D0I8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrto4Q9D0I8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrto4Q9D0I8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrto4Q9D0I8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrto4Q9D0I8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrto4Q9D0I8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrto4Q9D0I8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mrto4Q9D0I8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrto4Q9D0I8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrto4Q9D0I8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mrto4Q9D0I8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrto4Q9D0I8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrto4Q9D0I8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms