Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gins3Q9CY94 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins3Q9CY94 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins3Q9CY94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gins3Q9CY94 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gins3Q9CY94 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gins3Q9CY94 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gins3Q9CY94 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins3Q9CY94 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins3Q9CY94 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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