Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo1Q9CXH7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo1Q9CXH7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo1Q9CXH7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgo1Q9CXH7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgo1Q9CXH7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgo1Q9CXH7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sgo1Q9CXH7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgo1Q9CXH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgo1Q9CXH7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgo1Q9CXH7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo1Q9CXH7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgo1Q9CXH7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgo1Q9CXH7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgo1Q9CXH7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo1Q9CXH7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo1Q9CXH7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo1Q9CXH7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgo1Q9CXH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgo1Q9CXH7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgo1Q9CXH7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo1Q9CXH7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgo1Q9CXH7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgo1Q9CXH7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo1Q9CXH7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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