Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm5Q9CXE0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm5Q9CXE0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm5Q9CXE0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm5Q9CXE0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm5Q9CXE0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm5Q9CXE0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm5Q9CXE0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm5Q9CXE0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm5Q9CXE0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm5Q9CXE0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm5Q9CXE0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm5Q9CXE0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm5Q9CXE0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm5Q9CXE0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm5Q9CXE0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm5Q9CXE0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm5Q9CXE0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm5Q9CXE0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm5Q9CXE0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm5Q9CXE0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm5Q9CXE0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm5Q9CXE0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm5Q9CXE0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm5Q9CXE0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms